前者可高达5-10米，后者高2-6米。前者叶片为椭圆形或椭圆形长方形，后者为椭圆形或披针形，然后为倒卵状披针形。前者果实为长椭圆形、暗黄色，后者为卵圆形或近圆柱形，黄色表面有少量红色晕。

外观差异

木瓜树是灌木或小乔木，最高可达5-10米。一开始，枝条呈紫红色，有毛。两年后，枝条无毛，变成紫褐色，冬芽半圆形，顶端圆圆而钝。

木瓜海棠属小树落叶灌木，高2-6米，枝条呈紫褐色，无毛，冬芽为三脚架卵球形，顶端尖锐。

叶片差异

木瓜树的叶子呈椭圆形或椭圆形，很少倒卵形，一开始有大量的黄色和白色绒毛，很快就会脱落干净。

木瓜海棠的叶子呈椭圆形或披针形，到倒卵状披针形，最初有毛，下面有棕色绒毛，将来几乎没有毛。

果实差异

木瓜树果实呈长椭圆形，呈深黄色。

木瓜海棠果实呈卵球形或近圆柱形，呈黄色，略带红色晕。