在回答这个问题前，我想应该先明确一点，就是我们到底应该把中国上古神话和远古人类氏族社会联系起来，混在一起说，还是把神话的归神话人类社会的归人类社会。

中国的神话经过了一段非常奇怪的神的人化解释。这种解释把中国神解释为氏族首领，或者某个氏族的统治集团，或者干脆就是某个氏族历代统领的集合。个人认为这种胡乱的解释把本就有点混乱的中国上古神话弄得更加支离破碎，也更加无法从神话本身的角度去诠释神话。给神添加过多的人性，很显然会大幅弱化他的神性，弄到后来，其结果就是中国的神从人化的神变成了神化的人，然后就是随便什么阿猫阿狗都可以变成神，这已经完全脱离了神话的本身了。

虽然山海经等书中所记载的神话，有着某些原始社会的影子，但这很明显是在成书过程中想象并添加进去的。我觉得后世的人应该把这种东西剥离出来，而不是再去添油加醋。

有鉴于此，我认为尧帝杀鲧的故事就是一个神话，就是一个主神惩罚做错事的小神的故事。没有必要去掺杂什么政治。

尧帝杀鲧的理由有2。一是窃息壤，二是治水不力。有这2点，主神已经完全可以去惩罚小神了。

另外我觉得尧帝杀鲧不应该说成是杀害而是惩罚。和普罗米修斯一样，鲧也是犯了盗窃天庭物品的罪的。而不同的是普罗米修斯做了好事而鲧好心做了坏事。好心当然不能是做坏事而不被惩罚的理由。题主在提问中用了杀害这个词，可见题主本身对这件事是有倾向性的，建议题主还是神话归神话，世俗归世俗。

这部分是传说历史，并无文字记载，有无“鲧”这个人还是两说，中国人为了抬高一个人，往往要打低另一个人。例如《三国演义》，为了抬高诸葛亮就得把周瑜说得很小气。历史上真有其人尚且竭尽诋毁之事，无从考究的人物就更无所顾忌了，爱怎么捏造就怎么捏造。

在商朝有甲骨文之前，那些传说都只是传说，不能当历史来论证。